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艾滋病合并深部真菌感染的流行病学、耐药机制、抗真菌药物的合理应用，艾滋病合并结核分枝杆菌感染的流行病学、潜伏感染、抗结核与抗病毒治疗。
沈银忠，男，主治医师，博士，湖北省人。1995.7毕业于湖北民族学院医学院，2002.9-2005.7在昆明医学院攻读病原生物学硕士学位，获医学硕士学位，2005.9-2008.6于复旦大学攻读内科学（传染病学）博士学位，获医学博士学位。2008年7月进入上海市（复旦大学附属）公共卫生临床中心工作。博士在读期间被评为复旦大学优秀研究生，并获得一等奖学金，博士毕业时被评为复旦大学优秀毕业生。目前主要从事感染性疾病的诊治研究，尤其在艾滋病合并深部真菌感染的流行病学、耐药机制、抗真菌药物的合理应用；艾滋病合并结核分枝杆菌感染的流行病学、潜伏感染、抗结核与抗病毒治疗之间的相互作用；抗生素的合理使用；细菌耐药机制研究；临床统计设计等方面具有一定工作基础。从事感染性疾病的临床和基础工作，主要从事艾滋病合并真菌感染的临床和基础研究，参加卫生部、科技部、上海市科委、上海市卫生局等资助的多项科研项目，作为课题负责人已经完成云南省教育厅科研课题一项（编号：04J292C）和上海市卫生局青年科研项目一项（编号：2008Y030），并按时结题，作为子课题负责人承担“十一五”国家科技重大专项（编号：2009ZX10003-017）。2009年获得上海市科学技术进步三等奖（排名第四）。参编专业书籍7部。目前担任《上海医药》杂志编委。