南京市第一医院（南京医科大学附属南京医院），是卫生部首批三级甲等综合性医院。南京医科大学第三临床医学院、南京市心血管病医院、国家药物临床试验机构、国家首批心脏移植准入医院、国家首批工伤康复试点机构、国家良性前列腺增生健康管理基地、卫生部冠脉介入培训基地、卫生部内镜诊疗技术培训基地、卫计委临床药师培训

南京市第二医院(南京中医药大学附属南京医院，徐州医科大学南京第二临床学院，东南大学附属第二医院)，同时挂牌南京市肿瘤医院、南京市老年病医院。由宋美龄基金会创建于1933年，是集医疗、教学、科研、预防为一体，以“精专科、强综合、重防治、应突发”为特色的三级甲等医院。 医院现分为钟阜院区和汤山院区两个院

南京脑科医院，又名南京医科大学附属脑科医院，江苏省精神卫生中心，始建于1947年，是我国最早的国立神经精神病专科医院，承担着南京市、江苏省乃至全国神经、精神疾病的医疗、康复、预防、教学、科研、司法鉴定等任务，还承担着相关政府指令性工作及突发应急事件的心理救援等处置任务，在国家重大城市任务和突发公共卫

南京中医药大学第二附属医院（江苏省第二中医院）成立于1988年12月，为江苏省针灸推拿医院、江苏省第二红十字中医院、江苏省第二中医院互联网医院、南京中医药大学第二临床医学院，也是江苏省涉外教学医院。医院本部位于南京市河西地区，是一所融医疗、教学、科研、预防保健为一体的公立省级综合性三级甲等中医院。

　　南京江北人民医院始建于1934年，是南京江北地区规模最大、技术力量最强、功能最齐全的一所集医疗、教学、科研为一体的综合性三级医院。是东南大学和南通大学的附属医院。江苏省化工职业病防治所、江苏省石化系统急性中毒抢救中心、东南大学(江北)新生儿疾病研究所均设在该院，医院还承办着一份国家级医学期刊《中